Clavibacter michiganensis subsp. Michiganensis

Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis est l'agent causal du flétrissement bactérien et du chancre de la tomate (Lycopersicon esculentum). 

Hôtes et symptômes

Lorsque l'infection survient à un stade précoce du plant de tomate, il peut y avoir un flétrissement des feuilles parce que Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis pénètre dans la plante par des blessures, y compris des blessures aux racines, et si la bactérie atteint le xylème, une infection systémique est probable et peut obstruer les vaisseaux du xylème. Le flétrissement ne peut apparaître que sur un côté de la feuille et peut se rétablir pendant les périodes plus fraîches.  L'ensemble du système de xylème dans la plante permet aux bactéries de former des titres allant jusqu'à 10 9 bactéries par gramme de tissu végétal. Le flétrissement peut éventuellement se propager à toutes les feuilles et à ces feuilles, ainsi qu'à leurs pétioles, peut également montrer une croissance déformée et recourbée. Une façon de diagnostiquer une infection vasculaire grave consiste à pincer la tige. Si l' épiderme et la couche externe du cortex se séparent de la tige interne, il y a une infection vasculaire grave. Ces parties exposées auront une sensation savonneuse.  lésions de chancre, bien que rares, peuvent se développer sur la tige. Ces chancres sont des régions nécrotiques où l'épiderme a disparu. Au fur et à mesure que la bactérie poursuit sa colonisation, le chancre va s'approfondir et se développer. En termes de développement des fruits, les tomates peuvent ne pas se développer complètement ou peuvent sembler marbrées parce qu'elles ne mûrissent pas uniformément. 

Si l'infection survient à un stade avancé du développement des plantes, les plantes sont capables de survivre et de produire des fruits. Cependant, la plante peut sembler stressée plutôt que fanée et peut développer des zones interveinales blanches qui se développeront en tissu nécrotique brun. Souvent, les graines sont également infectées. 

Les infections superficielles augmentent le risque d'épidémie.  Ils se produisent lorsque les bactéries se multiplient sur l'épiderme de l'hôte, pénètrent par les stomates ou pénètrent par une plaie très peu profonde qui ne permet pas à l'agent pathogène d'atteindre le tissu du xylème. L'hôte peut avoir l'air d'avoir été frotté avec de la semoule de maïs ou de la farine grossière, mais il s'agit en fait d'une série de cloques qui me soulèvent ou coulent et apparaissent blanches à orange pâle.  Le symptôme foliaire le plus courant est une tache brun foncé entourée d'une sorte de zone orange sur le bord de la feuille. Les fruits peuvent développer des taches «à œil d'oiseau», qui sont des pustules surélevées vert pâle à blanches qui ont un centre brun et un halo chlorotique .  Des images de ces symptômes sont disponibles à la référence citée.

Cependant, les infections latentes sont courantes. 

Le Clavibacter michiganensis subsp. La souche NCPPB382 ​​de type sauvage de michiganensis porte deux plasmides associés à la virulence: pCM1 et pCM2. La souche avirulente, CMM100, ne contient pas ces plasmides. Les souches qui portaient l'un des deux plasmides se sont révélées virulentes mais les symptômes de flétrissement ont été retardés. Les souches virulentes et avirulentes ont produit la même quantité d’exopolysaccharides , ce qui suggère que l'EPS ne joue pas un rôle significatif dans la pathogénicité. 

Cycle de la maladie

L'agent causal du flétrissement bactérien et du chancre de la tomate survit dans ou sur les graines jusqu'à 8 mois, mais parfois aussi dans les déchets végétaux du sol. L'agent pathogène peut se propager sur de longues distances en raison de son association avec les graines.  Le risque de propagation de la bactérie à des plants de tomates sains est le plus grand pendant le repiquage , l'attachement et le drageonnage ou à tout moment où l'hôte peut être blessé. Une fois que la bactérie pénètre dans la plante par une blessure, elle se déplace et se multiplie principalement dans les vaisseaux du xylème. Une fois établies, les bactéries peuvent se déplacer dans le phloème , la moelle et le cortex.  L'infection peut entraîner une maladie systémique ou superficielle. Les infections systémiques apparaissent en 3 à 6 semaines et le risque d'infection secondaire augmente avec les éclaboussures d'eau.  L'occurrence courante d'infections latentes - présence du pathogène dans l'hôte mais l'hôte ne présente aucun symptôme - rend ce pathogène particulièrement dangereux. 

Cependant, l'hypothèse selon laquelle C. michiganensis ne passe pas l'hiver dans le sol n'est pas sans controverse. Le génome de C. michiganesis a récemment été séquencé et de nouvelles théories surgiront sûrement une fois que les travaux seront terminés. Ce que l'on sait, c'est que C.m.m. peut utiliser des produits d'hydrolyse comme sources de carbone et d'énergie au moyen d'un certain nombre de transporteurs de cassette de liaison à l'ATP et d' a- et ß-glucosidases .  Cela suggère que C.m.m. peut survivre dans le sol tant qu'il y a du matériel hôte en décomposition. Il a également été déterminé que le génome de subsp. michiganensis n'a pas de gènes codant pour les nitrate et nitrate réductases . Cela signifie que la bactérie dépend de composés azotés ou d' acides aminés préalablement réduits pour sa source d'azote.  Manquent également dans le génome C.m.m. sont des gènes pour la réduction assimilatrice de sulfate , qui est associée à une auxotrophie pour la méthionine - l'un des deux acides aminés qui contiennent du soufre . 

C.m.m. a un îlot de pathogénicité (IP) qui est codé dans le chromosome et est probablement associé à la colonisation et à l'évasion ou à la suppression de la défense des plantes. . Les sérines protéases des familles S1A, Ppa et PpA-E sont codées dans la sous-région chp ainsi que la subtilase SbtA. 

Environnement

Une température chaude comprise entre 23 et 28 ° Celsius et une humidité relative élevée (> 80%) sont des environnements optimaux pour Clavibacter michiganesis subsp. michiganesis, un développement de symptômes de chancre bactérien de la tomate. Par temps humide ou pluvieux, des masses visqueuses de bactéries suintent à travers les fissures à la surface de la tige, d'où elles se propagent aux feuilles et aux fruits et provoquent des infections secondaires.  Les plantes hôtes infectées présenteront de graves symptômes les jours chauds. Lorsqu’il y a un taux de transpiration élevé car les bactéries peuvent boucher les vaisseaux du xylème.

La gestion

La meilleure façon de lutter contre une maladie est d'utiliser des graines saines déjà extraites à l'acide. De plus, en utilisant des traitements chimiques tels que l'hydroxyde de cuivre  ou la streptomycine dans le lit de semence , l' élimination ou l'isolement des cultures malades peut être utile pour réduire le taux d'infection. 

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Date de dernière mise à jour : 26/10/2020